Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CARMIL3Q8ND23 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CARMIL3Q8ND23 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CARMIL3Q8ND23 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CARMIL3Q8ND23 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CARMIL3Q8ND23 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CARMIL3Q8ND23 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CARMIL3Q8ND23 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CARMIL3Q8ND23 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CARMIL3Q8ND23 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CARMIL3Q8ND23 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CARMIL3Q8ND23 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CARMIL3Q8ND23 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
CARMIL3Q8ND23 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CARMIL3Q8ND23 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CARMIL3Q8ND23 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CARMIL3Q8ND23 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CARMIL3Q8ND23 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CARMIL3Q8ND23 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
CARMIL3Q8ND23 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CARMIL3Q8ND23 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CARMIL3Q8ND23 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CARMIL3Q8ND23 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CARMIL3Q8ND23 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CARMIL3Q8ND23 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CARMIL3Q8ND23 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CARMIL3Q8ND23 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CARMIL3Q8ND23 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CARMIL3Q8ND23 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CARMIL3Q8ND23 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CARMIL3Q8ND23 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CARMIL3Q8ND23 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CARMIL3Q8ND23 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CARMIL3Q8ND23 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CARMIL3Q8ND23 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CARMIL3Q8ND23 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CARMIL3Q8ND23 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CARMIL3Q8ND23 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARMIL3Q8ND23 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARMIL3Q8ND23 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARMIL3Q8ND23 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARMIL3Q8ND23 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARMIL3Q8ND23 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARMIL3Q8ND23 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARMIL3Q8ND23 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARMIL3Q8ND23 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARMIL3Q8ND23 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
CARMIL3Q8ND23 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARMIL3Q8ND23 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARMIL3Q8ND23 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CARMIL3Q8ND23 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CARMIL3Q8ND23 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CARMIL3Q8ND23 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CARMIL3Q8ND23 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CARMIL3Q8ND23 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CARMIL3Q8ND23 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARMIL3Q8ND23 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CARMIL3Q8ND23 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CARMIL3Q8ND23 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARMIL3Q8ND23 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CARMIL3Q8ND23 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CARMIL3Q8ND23 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CARMIL3Q8ND23 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CARMIL3Q8ND23 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CARMIL3Q8ND23 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARMIL3Q8ND23 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARMIL3Q8ND23 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARMIL3Q8ND23 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARMIL3Q8ND23 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CARMIL3Q8ND23 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CARMIL3Q8ND23 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CARMIL3Q8ND23 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CARMIL3Q8ND23 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CARMIL3Q8ND23 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CARMIL3Q8ND23 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CARMIL3Q8ND23 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CARMIL3Q8ND23 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CARMIL3Q8ND23 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CARMIL3Q8ND23 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CARMIL3Q8ND23 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CARMIL3Q8ND23 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CARMIL3Q8ND23 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CARMIL3Q8ND23 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CARMIL3Q8ND23 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CARMIL3Q8ND23 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CARMIL3Q8ND23 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CARMIL3Q8ND23 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CARMIL3Q8ND23 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CARMIL3Q8ND23 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CARMIL3Q8ND23 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CARMIL3Q8ND23 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CARMIL3Q8ND23 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CARMIL3Q8ND23 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CARMIL3Q8ND23 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
CARMIL3Q8ND23 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.41
CARMIL3Q8ND23 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
CARMIL3Q8ND23 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CARMIL3Q8ND23 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CARMIL3Q8ND23 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CARMIL3Q8ND23 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms