Protein–RNA interactions for Protein: Q8N987

NECAB1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAB1Q8N987 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NECAB1Q8N987 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NECAB1Q8N987 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NECAB1Q8N987 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NECAB1Q8N987 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NECAB1Q8N987 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NECAB1Q8N987 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NECAB1Q8N987 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NECAB1Q8N987 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NECAB1Q8N987 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NECAB1Q8N987 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NECAB1Q8N987 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NECAB1Q8N987 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NECAB1Q8N987 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NECAB1Q8N987 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NECAB1Q8N987 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NECAB1Q8N987 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NECAB1Q8N987 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NECAB1Q8N987 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NECAB1Q8N987 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NECAB1Q8N987 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NECAB1Q8N987 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NECAB1Q8N987 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NECAB1Q8N987 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NECAB1Q8N987 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NECAB1Q8N987 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NECAB1Q8N987 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NECAB1Q8N987 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NECAB1Q8N987 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NECAB1Q8N987 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NECAB1Q8N987 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NECAB1Q8N987 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NECAB1Q8N987 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NECAB1Q8N987 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NECAB1Q8N987 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NECAB1Q8N987 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NECAB1Q8N987 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NECAB1Q8N987 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NECAB1Q8N987 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NECAB1Q8N987 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NECAB1Q8N987 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NECAB1Q8N987 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NECAB1Q8N987 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NECAB1Q8N987 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NECAB1Q8N987 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NECAB1Q8N987 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NECAB1Q8N987 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NECAB1Q8N987 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NECAB1Q8N987 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NECAB1Q8N987 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NECAB1Q8N987 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NECAB1Q8N987 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NECAB1Q8N987 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NECAB1Q8N987 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NECAB1Q8N987 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NECAB1Q8N987 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NECAB1Q8N987 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NECAB1Q8N987 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NECAB1Q8N987 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NECAB1Q8N987 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NECAB1Q8N987 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NECAB1Q8N987 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NECAB1Q8N987 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NECAB1Q8N987 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NECAB1Q8N987 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NECAB1Q8N987 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NECAB1Q8N987 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NECAB1Q8N987 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NECAB1Q8N987 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NECAB1Q8N987 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NECAB1Q8N987 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NECAB1Q8N987 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NECAB1Q8N987 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NECAB1Q8N987 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NECAB1Q8N987 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NECAB1Q8N987 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NECAB1Q8N987 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NECAB1Q8N987 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NECAB1Q8N987 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NECAB1Q8N987 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NECAB1Q8N987 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NECAB1Q8N987 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NECAB1Q8N987 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NECAB1Q8N987 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NECAB1Q8N987 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NECAB1Q8N987 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NECAB1Q8N987 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NECAB1Q8N987 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NECAB1Q8N987 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NECAB1Q8N987 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NECAB1Q8N987 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NECAB1Q8N987 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NECAB1Q8N987 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NECAB1Q8N987 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NECAB1Q8N987 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NECAB1Q8N987 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NECAB1Q8N987 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NECAB1Q8N987 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NECAB1Q8N987 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NECAB1Q8N987 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms