Protein–RNA interactions for Protein: Q8N187

CARF, Calcium-responsive transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARFQ8N187 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CARFQ8N187 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARFQ8N187 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CARFQ8N187 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARFQ8N187 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARFQ8N187 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARFQ8N187 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CARFQ8N187 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARFQ8N187 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARFQ8N187 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARFQ8N187 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARFQ8N187 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARFQ8N187 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARFQ8N187 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARFQ8N187 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARFQ8N187 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARFQ8N187 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARFQ8N187 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARFQ8N187 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARFQ8N187 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARFQ8N187 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARFQ8N187 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARFQ8N187 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CARFQ8N187 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARFQ8N187 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARFQ8N187 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARFQ8N187 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARFQ8N187 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARFQ8N187 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARFQ8N187 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CARFQ8N187 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARFQ8N187 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CARFQ8N187 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARFQ8N187 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARFQ8N187 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARFQ8N187 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARFQ8N187 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms