Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYD8

FANCM, Fanconi anemia group M protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCMQ8IYD8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCMQ8IYD8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCMQ8IYD8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCMQ8IYD8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCMQ8IYD8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCMQ8IYD8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCMQ8IYD8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCMQ8IYD8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCMQ8IYD8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCMQ8IYD8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCMQ8IYD8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCMQ8IYD8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCMQ8IYD8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCMQ8IYD8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCMQ8IYD8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCMQ8IYD8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCMQ8IYD8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCMQ8IYD8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCMQ8IYD8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCMQ8IYD8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCMQ8IYD8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCMQ8IYD8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCMQ8IYD8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCMQ8IYD8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FANCMQ8IYD8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCMQ8IYD8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCMQ8IYD8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCMQ8IYD8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCMQ8IYD8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCMQ8IYD8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCMQ8IYD8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCMQ8IYD8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCMQ8IYD8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCMQ8IYD8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCMQ8IYD8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCMQ8IYD8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCMQ8IYD8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCMQ8IYD8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCMQ8IYD8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCMQ8IYD8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCMQ8IYD8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCMQ8IYD8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCMQ8IYD8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCMQ8IYD8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCMQ8IYD8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCMQ8IYD8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCMQ8IYD8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCMQ8IYD8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCMQ8IYD8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCMQ8IYD8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCMQ8IYD8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FANCMQ8IYD8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FANCMQ8IYD8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FANCMQ8IYD8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FANCMQ8IYD8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FANCMQ8IYD8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FANCMQ8IYD8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCMQ8IYD8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCMQ8IYD8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCMQ8IYD8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCMQ8IYD8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms