Protein–RNA interactions for Protein: Q86UP9

LHFPL3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHFPL3Q86UP9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LHFPL3Q86UP9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
LHFPL3Q86UP9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LHFPL3Q86UP9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms