Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTU1Q7Z7A3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTU1Q7Z7A3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTU1Q7Z7A3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTU1Q7Z7A3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CTU1Q7Z7A3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTU1Q7Z7A3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTU1Q7Z7A3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTU1Q7Z7A3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTU1Q7Z7A3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTU1Q7Z7A3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTU1Q7Z7A3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTU1Q7Z7A3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CTU1Q7Z7A3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTU1Q7Z7A3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CTU1Q7Z7A3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTU1Q7Z7A3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTU1Q7Z7A3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTU1Q7Z7A3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTU1Q7Z7A3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CTU1Q7Z7A3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTU1Q7Z7A3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTU1Q7Z7A3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTU1Q7Z7A3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CTU1Q7Z7A3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTU1Q7Z7A3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTU1Q7Z7A3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CTU1Q7Z7A3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTU1Q7Z7A3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTU1Q7Z7A3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTU1Q7Z7A3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CTU1Q7Z7A3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTU1Q7Z7A3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTU1Q7Z7A3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTU1Q7Z7A3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTU1Q7Z7A3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CTU1Q7Z7A3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTU1Q7Z7A3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTU1Q7Z7A3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CTU1Q7Z7A3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTU1Q7Z7A3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTU1Q7Z7A3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTU1Q7Z7A3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CTU1Q7Z7A3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTU1Q7Z7A3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTU1Q7Z7A3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CTU1Q7Z7A3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CTU1Q7Z7A3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CTU1Q7Z7A3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CTU1Q7Z7A3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTU1Q7Z7A3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CTU1Q7Z7A3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTU1Q7Z7A3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CTU1Q7Z7A3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CTU1Q7Z7A3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CTU1Q7Z7A3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CTU1Q7Z7A3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CTU1Q7Z7A3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTU1Q7Z7A3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTU1Q7Z7A3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CTU1Q7Z7A3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTU1Q7Z7A3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTU1Q7Z7A3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTU1Q7Z7A3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTU1Q7Z7A3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CTU1Q7Z7A3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
CTU1Q7Z7A3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CTU1Q7Z7A3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTU1Q7Z7A3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CTU1Q7Z7A3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CTU1Q7Z7A3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CTU1Q7Z7A3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTU1Q7Z7A3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CTU1Q7Z7A3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CTU1Q7Z7A3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms