Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR53Q7Z5U6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR53Q7Z5U6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR53Q7Z5U6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR53Q7Z5U6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR53Q7Z5U6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR53Q7Z5U6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
WDR53Q7Z5U6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR53Q7Z5U6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR53Q7Z5U6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR53Q7Z5U6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR53Q7Z5U6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR53Q7Z5U6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR53Q7Z5U6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR53Q7Z5U6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR53Q7Z5U6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR53Q7Z5U6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR53Q7Z5U6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR53Q7Z5U6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR53Q7Z5U6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR53Q7Z5U6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR53Q7Z5U6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR53Q7Z5U6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR53Q7Z5U6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR53Q7Z5U6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR53Q7Z5U6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR53Q7Z5U6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR53Q7Z5U6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR53Q7Z5U6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR53Q7Z5U6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR53Q7Z5U6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR53Q7Z5U6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR53Q7Z5U6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR53Q7Z5U6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR53Q7Z5U6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR53Q7Z5U6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR53Q7Z5U6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR53Q7Z5U6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR53Q7Z5U6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR53Q7Z5U6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR53Q7Z5U6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR53Q7Z5U6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR53Q7Z5U6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR53Q7Z5U6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms