Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2P2

PRMT9, Protein arginine N-methyltransferase 9, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRMT9Q6P2P2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRMT9Q6P2P2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRMT9Q6P2P2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRMT9Q6P2P2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRMT9Q6P2P2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRMT9Q6P2P2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRMT9Q6P2P2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRMT9Q6P2P2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRMT9Q6P2P2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRMT9Q6P2P2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRMT9Q6P2P2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRMT9Q6P2P2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRMT9Q6P2P2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRMT9Q6P2P2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRMT9Q6P2P2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRMT9Q6P2P2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRMT9Q6P2P2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRMT9Q6P2P2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRMT9Q6P2P2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRMT9Q6P2P2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRMT9Q6P2P2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRMT9Q6P2P2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRMT9Q6P2P2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRMT9Q6P2P2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRMT9Q6P2P2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRMT9Q6P2P2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRMT9Q6P2P2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRMT9Q6P2P2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRMT9Q6P2P2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRMT9Q6P2P2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRMT9Q6P2P2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRMT9Q6P2P2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRMT9Q6P2P2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRMT9Q6P2P2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRMT9Q6P2P2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRMT9Q6P2P2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRMT9Q6P2P2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRMT9Q6P2P2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRMT9Q6P2P2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRMT9Q6P2P2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRMT9Q6P2P2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRMT9Q6P2P2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRMT9Q6P2P2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRMT9Q6P2P2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRMT9Q6P2P2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRMT9Q6P2P2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRMT9Q6P2P2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRMT9Q6P2P2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRMT9Q6P2P2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRMT9Q6P2P2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRMT9Q6P2P2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms