Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED27Q6P2C8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MED27Q6P2C8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED27Q6P2C8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms