Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPP4R4Q6NUP7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP4R4Q6NUP7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP4R4Q6NUP7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms