Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf140Q5VVS0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf140Q5VVS0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf140Q5VVS0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms