Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRF9

SAMD4B, Protein Smaug homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4BQ5PRF9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD4BQ5PRF9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMD4BQ5PRF9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms