Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ08

SPANXN4, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN4Q5MJ08 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPANXN4Q5MJ08 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPANXN4Q5MJ08 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPANXN4Q5MJ08 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPANXN4Q5MJ08 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPANXN4Q5MJ08 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPANXN4Q5MJ08 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPANXN4Q5MJ08 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPANXN4Q5MJ08 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPANXN4Q5MJ08 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPANXN4Q5MJ08 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPANXN4Q5MJ08 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPANXN4Q5MJ08 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms