Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TNNI3KQ59H18 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNNI3KQ59H18 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNNI3KQ59H18 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNNI3KQ59H18 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNNI3KQ59H18 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNNI3KQ59H18 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNNI3KQ59H18 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNNI3KQ59H18 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNNI3KQ59H18 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNNI3KQ59H18 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNNI3KQ59H18 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNNI3KQ59H18 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNNI3KQ59H18 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNNI3KQ59H18 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNNI3KQ59H18 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
TNNI3KQ59H18 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TNNI3KQ59H18 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
TNNI3KQ59H18 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TNNI3KQ59H18 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNNI3KQ59H18 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNNI3KQ59H18 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNNI3KQ59H18 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNNI3KQ59H18 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNNI3KQ59H18 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNNI3KQ59H18 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNNI3KQ59H18 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNNI3KQ59H18 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNNI3KQ59H18 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TNNI3KQ59H18 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNNI3KQ59H18 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNNI3KQ59H18 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNNI3KQ59H18 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNNI3KQ59H18 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TNNI3KQ59H18 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNNI3KQ59H18 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNNI3KQ59H18 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNNI3KQ59H18 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNNI3KQ59H18 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNNI3KQ59H18 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNNI3KQ59H18 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNNI3KQ59H18 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNNI3KQ59H18 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNNI3KQ59H18 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNNI3KQ59H18 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNNI3KQ59H18 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNNI3KQ59H18 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNNI3KQ59H18 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNNI3KQ59H18 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNNI3KQ59H18 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNNI3KQ59H18 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TNNI3KQ59H18 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNNI3KQ59H18 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNNI3KQ59H18 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNNI3KQ59H18 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNNI3KQ59H18 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNNI3KQ59H18 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNNI3KQ59H18 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNNI3KQ59H18 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNNI3KQ59H18 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNNI3KQ59H18 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNNI3KQ59H18 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNNI3KQ59H18 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNNI3KQ59H18 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNNI3KQ59H18 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNNI3KQ59H18 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNNI3KQ59H18 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNNI3KQ59H18 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNNI3KQ59H18 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNNI3KQ59H18 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TNNI3KQ59H18 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNNI3KQ59H18 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNNI3KQ59H18 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TNNI3KQ59H18 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNNI3KQ59H18 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNNI3KQ59H18 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TNNI3KQ59H18 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNNI3KQ59H18 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNNI3KQ59H18 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNNI3KQ59H18 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNNI3KQ59H18 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNNI3KQ59H18 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNNI3KQ59H18 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNNI3KQ59H18 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TNNI3KQ59H18 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNNI3KQ59H18 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNNI3KQ59H18 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNNI3KQ59H18 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNNI3KQ59H18 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNNI3KQ59H18 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNNI3KQ59H18 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TNNI3KQ59H18 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNNI3KQ59H18 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNNI3KQ59H18 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNNI3KQ59H18 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNNI3KQ59H18 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNNI3KQ59H18 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNNI3KQ59H18 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNNI3KQ59H18 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNNI3KQ59H18 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms