Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFT2D3Q587I9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFT2D3Q587I9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFT2D3Q587I9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFT2D3Q587I9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFT2D3Q587I9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFT2D3Q587I9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFT2D3Q587I9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFT2D3Q587I9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFT2D3Q587I9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SFT2D3Q587I9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SFT2D3Q587I9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFT2D3Q587I9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFT2D3Q587I9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFT2D3Q587I9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFT2D3Q587I9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFT2D3Q587I9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFT2D3Q587I9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFT2D3Q587I9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SFT2D3Q587I9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFT2D3Q587I9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFT2D3Q587I9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFT2D3Q587I9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SFT2D3Q587I9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFT2D3Q587I9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFT2D3Q587I9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFT2D3Q587I9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFT2D3Q587I9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFT2D3Q587I9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SFT2D3Q587I9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFT2D3Q587I9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFT2D3Q587I9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFT2D3Q587I9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFT2D3Q587I9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFT2D3Q587I9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFT2D3Q587I9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFT2D3Q587I9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFT2D3Q587I9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFT2D3Q587I9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SFT2D3Q587I9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SFT2D3Q587I9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFT2D3Q587I9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms