Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TXNRD1Q16881 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TXNRD1Q16881 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
TXNRD1Q16881 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TXNRD1Q16881 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TXNRD1Q16881 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TXNRD1Q16881 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TXNRD1Q16881 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
TXNRD1Q16881 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
TXNRD1Q16881 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TXNRD1Q16881 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TXNRD1Q16881 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TXNRD1Q16881 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TXNRD1Q16881 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TXNRD1Q16881 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TXNRD1Q16881 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TXNRD1Q16881 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TXNRD1Q16881 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
TXNRD1Q16881 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TXNRD1Q16881 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TXNRD1Q16881 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TXNRD1Q16881 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TXNRD1Q16881 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TXNRD1Q16881 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TXNRD1Q16881 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TXNRD1Q16881 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TXNRD1Q16881 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TXNRD1Q16881 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TXNRD1Q16881 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TXNRD1Q16881 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
TXNRD1Q16881 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TXNRD1Q16881 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TXNRD1Q16881 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TXNRD1Q16881 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TXNRD1Q16881 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TXNRD1Q16881 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TXNRD1Q16881 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
TXNRD1Q16881 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TXNRD1Q16881 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TXNRD1Q16881 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TXNRD1Q16881 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TXNRD1Q16881 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TXNRD1Q16881 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TXNRD1Q16881 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TXNRD1Q16881 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TXNRD1Q16881 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TXNRD1Q16881 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TXNRD1Q16881 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TXNRD1Q16881 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TXNRD1Q16881 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TXNRD1Q16881 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TXNRD1Q16881 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
TXNRD1Q16881 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TXNRD1Q16881 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TXNRD1Q16881 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TXNRD1Q16881 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TXNRD1Q16881 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
TXNRD1Q16881 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TXNRD1Q16881 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TXNRD1Q16881 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TXNRD1Q16881 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TXNRD1Q16881 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TXNRD1Q16881 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TXNRD1Q16881 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TXNRD1Q16881 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TXNRD1Q16881 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TXNRD1Q16881 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TXNRD1Q16881 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TXNRD1Q16881 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TXNRD1Q16881 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TXNRD1Q16881 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TXNRD1Q16881 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TXNRD1Q16881 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TXNRD1Q16881 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TXNRD1Q16881 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TXNRD1Q16881 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TXNRD1Q16881 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TXNRD1Q16881 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TXNRD1Q16881 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TXNRD1Q16881 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TXNRD1Q16881 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TXNRD1Q16881 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TXNRD1Q16881 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TXNRD1Q16881 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TXNRD1Q16881 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
TXNRD1Q16881 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
TXNRD1Q16881 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TXNRD1Q16881 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TXNRD1Q16881 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TXNRD1Q16881 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TXNRD1Q16881 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TXNRD1Q16881 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TXNRD1Q16881 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TXNRD1Q16881 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TXNRD1Q16881 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TXNRD1Q16881 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
TXNRD1Q16881 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TXNRD1Q16881 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TXNRD1Q16881 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TXNRD1Q16881 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
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