Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SSX2Q16385 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSX2Q16385 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms