Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNCBQ16143 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNCBQ16143 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
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