Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL19A1Q14993 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL19A1Q14993 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL19A1Q14993 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL19A1Q14993 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL19A1Q14993 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL19A1Q14993 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL19A1Q14993 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL19A1Q14993 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL19A1Q14993 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
COL19A1Q14993 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL19A1Q14993 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL19A1Q14993 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL19A1Q14993 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL19A1Q14993 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
COL19A1Q14993 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL19A1Q14993 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL19A1Q14993 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL19A1Q14993 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL19A1Q14993 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COL19A1Q14993 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL19A1Q14993 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COL19A1Q14993 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL19A1Q14993 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL19A1Q14993 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL19A1Q14993 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
COL19A1Q14993 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL19A1Q14993 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL19A1Q14993 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COL19A1Q14993 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL19A1Q14993 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL19A1Q14993 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL19A1Q14993 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COL19A1Q14993 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL19A1Q14993 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL19A1Q14993 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL19A1Q14993 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL19A1Q14993 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL19A1Q14993 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL19A1Q14993 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COL19A1Q14993 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL19A1Q14993 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL19A1Q14993 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL19A1Q14993 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
COL19A1Q14993 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL19A1Q14993 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL19A1Q14993 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL19A1Q14993 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL19A1Q14993 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL19A1Q14993 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
COL19A1Q14993 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL19A1Q14993 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL19A1Q14993 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL19A1Q14993 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL19A1Q14993 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL19A1Q14993 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL19A1Q14993 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL19A1Q14993 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
COL19A1Q14993 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL19A1Q14993 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
COL19A1Q14993 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL19A1Q14993 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL19A1Q14993 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL19A1Q14993 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL19A1Q14993 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL19A1Q14993 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL19A1Q14993 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
COL19A1Q14993 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL19A1Q14993 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL19A1Q14993 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL19A1Q14993 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL19A1Q14993 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL19A1Q14993 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL19A1Q14993 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL19A1Q14993 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
COL19A1Q14993 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL19A1Q14993 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL19A1Q14993 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL19A1Q14993 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL19A1Q14993 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL19A1Q14993 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL19A1Q14993 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL19A1Q14993 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
COL19A1Q14993 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL19A1Q14993 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL19A1Q14993 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
COL19A1Q14993 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL19A1Q14993 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL19A1Q14993 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL19A1Q14993 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL19A1Q14993 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL19A1Q14993 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL19A1Q14993 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL19A1Q14993 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL19A1Q14993 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
COL19A1Q14993 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL19A1Q14993 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL19A1Q14993 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL19A1Q14993 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL19A1Q14993 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
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