Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRDNQ13061 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRDNQ13061 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRDNQ13061 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRDNQ13061 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRDNQ13061 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRDNQ13061 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRDNQ13061 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRDNQ13061 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRDNQ13061 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRDNQ13061 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRDNQ13061 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRDNQ13061 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRDNQ13061 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRDNQ13061 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRDNQ13061 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRDNQ13061 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRDNQ13061 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRDNQ13061 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TRDNQ13061 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRDNQ13061 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRDNQ13061 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRDNQ13061 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRDNQ13061 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRDNQ13061 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRDNQ13061 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRDNQ13061 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TRDNQ13061 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRDNQ13061 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRDNQ13061 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TRDNQ13061 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRDNQ13061 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRDNQ13061 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRDNQ13061 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRDNQ13061 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRDNQ13061 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRDNQ13061 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRDNQ13061 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRDNQ13061 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRDNQ13061 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TRDNQ13061 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TRDNQ13061 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TRDNQ13061 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRDNQ13061 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRDNQ13061 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRDNQ13061 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRDNQ13061 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRDNQ13061 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRDNQ13061 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRDNQ13061 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRDNQ13061 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TRDNQ13061 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRDNQ13061 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRDNQ13061 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRDNQ13061 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRDNQ13061 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRDNQ13061 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TRDNQ13061 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRDNQ13061 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRDNQ13061 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRDNQ13061 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRDNQ13061 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRDNQ13061 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRDNQ13061 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRDNQ13061 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRDNQ13061 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRDNQ13061 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRDNQ13061 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRDNQ13061 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRDNQ13061 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRDNQ13061 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRDNQ13061 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRDNQ13061 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRDNQ13061 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRDNQ13061 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRDNQ13061 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRDNQ13061 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRDNQ13061 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRDNQ13061 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRDNQ13061 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TRDNQ13061 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRDNQ13061 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRDNQ13061 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRDNQ13061 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRDNQ13061 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TRDNQ13061 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRDNQ13061 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRDNQ13061 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRDNQ13061 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRDNQ13061 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRDNQ13061 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRDNQ13061 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRDNQ13061 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRDNQ13061 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRDNQ13061 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRDNQ13061 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRDNQ13061 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRDNQ13061 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TRDNQ13061 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRDNQ13061 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
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