Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 CTTN-206ENST00000482755 1087 ntTSL 219.53■□□□□ 0.726e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 HPN-208ENST00000600390 564 ntTSL 418.92■□□□□ 0.626e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 CTTN-211ENST00000527622 597 ntTSL 418.75■□□□□ 0.596e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.556e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 UTP4-203ENST00000562237 2186 ntTSL 1 (best)18.05■□□□□ 0.486e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 FKBP10-209ENST00000585922 563 ntTSL 417.9■□□□□ 0.466e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 DRG2-219ENST00000583162 1066 ntTSL 217.43■□□□□ 0.386e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.36e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 FKBP10-202ENST00000429461 398 ntTSL 316.53■□□□□ 0.246e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 DRG2-206ENST00000496428 795 ntTSL 316.35■□□□□ 0.216e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 NFIX-206ENST00000586797 1615 ntTSL 516.33■□□□□ 0.26e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.26e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.26e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 UTP4-209ENST00000567235 586 ntTSL 516.22■□□□□ 0.196e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 DRG2-209ENST00000577771 641 ntTSL 216.15■□□□□ 0.186e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.166e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.136e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 DRG2-216ENST00000582314 1530 ntTSL 515.86■□□□□ 0.136e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.086e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 FKBP10-206ENST00000489591 2826 ntTSL 215.36■□□□□ 0.056e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.036e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 RAB11FIP3-208ENST00000464263 329 ntTSL 315.22■□□□□ 0.036e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.99□□□□□ -0.016e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 PEBP1-202ENST00000542939 708 ntTSL 314.79□□□□□ -0.046e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.076e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 UTP4-213ENST00000568448 562 ntTSL 414.37□□□□□ -0.116e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.126e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.146e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 DRG2-203ENST00000467099 2531 ntTSL 214.14□□□□□ -0.156e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 DRG2-214ENST00000580055 1838 ntTSL 514.07□□□□□ -0.166e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 FKBP10-208ENST00000585664 598 ntTSL 313.39□□□□□ -0.276e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 RAB11FIP3-207ENST00000461009 514 ntTSL 213.12□□□□□ -0.316e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.356e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 NFIX-201ENST00000358552 1727 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.366e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 MRPL45-204ENST00000619548 1554 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.466e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 NFIX-204ENST00000585382 1083 ntTSL 512.08□□□□□ -0.486e-8■■■■■ 27.3
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ILF3Q12906 UTP4-208ENST00000567015 690 ntTSL 211.73□□□□□ -0.536e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 DRG2-221ENST00000584212 465 ntTSL 411.57□□□□□ -0.566e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 DRG2-213ENST00000579601 550 ntTSL 411.57□□□□□ -0.566e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 DRG2-208ENST00000577450 566 ntTSL 411.57□□□□□ -0.566e-8■■■■■ 27.3
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ILF3Q12906 DRG2-215ENST00000580929 389 ntTSL 511.4□□□□□ -0.586e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 PRRC2B-202ENST00000357304 11042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.713e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 MRPL45-203ENST00000613675 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.746e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 DRG2-210ENST00000578173 535 ntTSL 210.25□□□□□ -0.776e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 RBMX-206ENST00000561733 837 ntTSL 310.2□□□□□ -0.788e-7■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 UTP4-202ENST00000352319 1841 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.796e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 UTP4-207ENST00000566227 747 ntTSL 39.82□□□□□ -0.846e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 UQCC1-222ENST00000497717 471 ntTSL 57.7□□□□□ -1.186e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 UTP4-205ENST00000563299 581 ntTSL 37.6□□□□□ -1.196e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 PLIN2-207ENST00000475923 1000 ntTSL 37.21□□□□□ -1.264e-15■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.296e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.34e-15■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 DRG2-211ENST00000578767 577 ntTSL 46.55□□□□□ -1.366e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 PLIN2-204ENST00000434144 623 ntTSL 36.02□□□□□ -1.454e-15■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.564e-15■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.816e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 NUP214-215ENST00000525980 2274 ntTSL 28.32□□□□□ -1.081e-6■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 TBC1D5-223ENST00000471679 435 ntTSL 423.07■■□□□ 1.281e-6■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 TBC1D5-227ENST00000485432 566 ntTSL 420.62■□□□□ 0.891e-6■■■■■ 27.3
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ILF3Q12906 TBC1D5-226ENST00000481396 609 ntTSL 413.15□□□□□ -0.31e-6■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 ZC3HC1-210ENST00000483827 760 ntTSL 514.7□□□□□ -0.061e-7■■■■■ 27.2
ILF3Q12906 C8orf44-204ENST00000521113 575 ntTSL 29.12□□□□□ -0.953e-9■■■■■ 27.2
ILF3Q12906 C8orf44-SGK3-201ENST00000519289 2949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.083e-9■■■■■ 27.2
ILF3Q12906 C8orf44-SGK3-202ENST00000520044 628 ntTSL 35.08□□□□□ -1.63e-9■■■■■ 27.2
ILF3Q12906 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.223e-8■■■■■ 27.2
ILF3Q12906 ANKRD17-202ENST00000358602 10784 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.53e-8■■■■■ 27.2
ILF3Q12906 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.263e-8■■■■■ 27.2
ILF3Q12906 ANKRD17-207ENST00000558247 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)6.14□□□□□ -1.433e-8■■■■■ 27.2
ILF3Q12906 LRIG2-201ENST00000361127 11555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.121e-11■■■■■ 27.2
ILF3Q12906 LRIG2-205ENST00000492207 5076 ntTSL 56.92□□□□□ -1.31e-11■■■■■ 27.2
ILF3Q12906 LRIG2-203ENST00000466161 3366 ntTSL 25.63□□□□□ -1.511e-11■■■■■ 27.2
ILF3Q12906 LRIG2-202ENST00000466069 564 ntTSL 23.49□□□□□ -1.851e-11■■■■■ 27.2
ILF3Q12906 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.822e-6■■■■■ 27.2
ILF3Q12906 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 27.2
ILF3Q12906 P4HA2-205ENST00000379104 2569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.662e-6■■■■■ 27.2
ILF3Q12906 P4HA2-204ENST00000379100 2563 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.662e-6■■■■■ 27.2
ILF3Q12906 P4HA2-203ENST00000379086 2223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.822e-6■■■■■ 27.2
ILF3Q12906 P4HA2-207ENST00000401867 3349 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.852e-6■■■■■ 27.2
ILF3Q12906 LINC00894-204ENST00000444489 2951 ntTSL 510.32□□□□□ -0.767e-9■■■■■ 27.2
ILF3Q12906 LINC00894-205ENST00000449111 3414 ntTSL 58.85□□□□□ -0.997e-9■■■■■ 27.2
ILF3Q12906 ZNF627-203ENST00000587939 591 ntTSL 413.74□□□□□ -0.212e-8■■■■■ 27.2
ILF3Q12906 ZNF627-201ENST00000361113 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.662e-8■■■■■ 27.2
ILF3Q12906 ZNF627-204ENST00000588174 2755 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.672e-8■■■■■ 27.2
ILF3Q12906 ZNF627-202ENST00000585493 541 ntTSL 48.62□□□□□ -1.032e-8■■■■■ 27.2
ILF3Q12906 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.385e-12■■■■■ 27.1
ILF3Q12906 PRH1-202ENST00000536086 554 ntTSL 54.38□□□□□ -1.715e-12■■■■■ 27.1
ILF3Q12906 PRR4-209ENST00000541456 454 ntTSL 34.09□□□□□ -1.755e-12■■■■■ 27.1
ILF3Q12906 PRR4-202ENST00000534923 533 ntTSL 23.56□□□□□ -1.845e-12■■■■■ 27.1
ILF3Q12906 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.31e-6■■■■■ 27.1
ILF3Q12906 CCDC26-202ENST00000520048 904 ntTSL 38.3□□□□□ -1.084e-7■■■■■ 27.1
ILF3Q12906 CCDC26-203ENST00000523151 1496 ntTSL 1 (best)7.9□□□□□ -1.144e-7■■■■■ 27.1
ILF3Q12906 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.454e-7■■■■■ 27.1
ILF3Q12906 C2orf42-212ENST00000470096 579 ntTSL 416.33■□□□□ 0.29e-9■■■■■ 27.1
ILF3Q12906 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.189e-9■■■■■ 27.1
ILF3Q12906 TIA1-210ENST00000474809 915 ntTSL 512.92□□□□□ -0.349e-9■■■■■ 27.1
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