Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMAGPQ0VAQ4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms