Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SSRP1Q08945 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SSRP1Q08945 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SSRP1Q08945 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SSRP1Q08945 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SSRP1Q08945 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SSRP1Q08945 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SSRP1Q08945 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SSRP1Q08945 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SSRP1Q08945 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SSRP1Q08945 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SSRP1Q08945 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SSRP1Q08945 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SSRP1Q08945 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SSRP1Q08945 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SSRP1Q08945 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SSRP1Q08945 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SSRP1Q08945 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SSRP1Q08945 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SSRP1Q08945 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SSRP1Q08945 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SSRP1Q08945 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SSRP1Q08945 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SSRP1Q08945 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SSRP1Q08945 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SSRP1Q08945 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SSRP1Q08945 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SSRP1Q08945 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SSRP1Q08945 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SSRP1Q08945 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SSRP1Q08945 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SSRP1Q08945 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SSRP1Q08945 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SSRP1Q08945 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SSRP1Q08945 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SSRP1Q08945 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SSRP1Q08945 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SSRP1Q08945 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SSRP1Q08945 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SSRP1Q08945 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SSRP1Q08945 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SSRP1Q08945 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SSRP1Q08945 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SSRP1Q08945 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SSRP1Q08945 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SSRP1Q08945 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SSRP1Q08945 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SSRP1Q08945 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SSRP1Q08945 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SSRP1Q08945 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SSRP1Q08945 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SSRP1Q08945 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SSRP1Q08945 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SSRP1Q08945 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SSRP1Q08945 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SSRP1Q08945 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SSRP1Q08945 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SSRP1Q08945 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SSRP1Q08945 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SSRP1Q08945 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SSRP1Q08945 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SSRP1Q08945 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SSRP1Q08945 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SSRP1Q08945 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SSRP1Q08945 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SSRP1Q08945 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SSRP1Q08945 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SSRP1Q08945 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SSRP1Q08945 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SSRP1Q08945 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SSRP1Q08945 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SSRP1Q08945 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SSRP1Q08945 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SSRP1Q08945 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SSRP1Q08945 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SSRP1Q08945 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SSRP1Q08945 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SSRP1Q08945 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSRP1Q08945 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSRP1Q08945 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSRP1Q08945 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSRP1Q08945 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSRP1Q08945 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSRP1Q08945 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSRP1Q08945 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSRP1Q08945 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSRP1Q08945 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSRP1Q08945 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSRP1Q08945 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSRP1Q08945 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSRP1Q08945 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSRP1Q08945 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSRP1Q08945 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSRP1Q08945 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SSRP1Q08945 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SSRP1Q08945 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
SSRP1Q08945 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SSRP1Q08945 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SSRP1Q08945 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SSRP1Q08945 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.3 ms