Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUNX1T1Q06455 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNX1T1Q06455 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNX1T1Q06455 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms