Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK5Q00535 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK5Q00535 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK5Q00535 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK5Q00535 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK5Q00535 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5Q00535 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5Q00535 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5Q00535 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5Q00535 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5Q00535 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5Q00535 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5Q00535 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5Q00535 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5Q00535 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5Q00535 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK5Q00535 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK5Q00535 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK5Q00535 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK5Q00535 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK5Q00535 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK5Q00535 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK5Q00535 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK5Q00535 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK5Q00535 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK5Q00535 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK5Q00535 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5Q00535 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5Q00535 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5Q00535 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5Q00535 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK5Q00535 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK5Q00535 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK5Q00535 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK5Q00535 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK5Q00535 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK5Q00535 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK5Q00535 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5Q00535 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms