Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TFAMQ00059 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TFAMQ00059 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFAMQ00059 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TFAMQ00059 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFAMQ00059 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFAMQ00059 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFAMQ00059 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TFAMQ00059 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFAMQ00059 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFAMQ00059 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFAMQ00059 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TFAMQ00059 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TFAMQ00059 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TFAMQ00059 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TFAMQ00059 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TFAMQ00059 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TFAMQ00059 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TFAMQ00059 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TFAMQ00059 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TFAMQ00059 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TFAMQ00059 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TFAMQ00059 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TFAMQ00059 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TFAMQ00059 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TFAMQ00059 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TFAMQ00059 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TFAMQ00059 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TFAMQ00059 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TFAMQ00059 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TFAMQ00059 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TFAMQ00059 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TFAMQ00059 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TFAMQ00059 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TFAMQ00059 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TFAMQ00059 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TFAMQ00059 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TFAMQ00059 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TFAMQ00059 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TFAMQ00059 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TFAMQ00059 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TFAMQ00059 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TFAMQ00059 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TFAMQ00059 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TFAMQ00059 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TFAMQ00059 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TFAMQ00059 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TFAMQ00059 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TFAMQ00059 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TFAMQ00059 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TFAMQ00059 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TFAMQ00059 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TFAMQ00059 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFAMQ00059 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFAMQ00059 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFAMQ00059 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFAMQ00059 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFAMQ00059 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFAMQ00059 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFAMQ00059 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFAMQ00059 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFAMQ00059 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFAMQ00059 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFAMQ00059 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFAMQ00059 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFAMQ00059 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFAMQ00059 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFAMQ00059 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFAMQ00059 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFAMQ00059 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TFAMQ00059 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFAMQ00059 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFAMQ00059 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFAMQ00059 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFAMQ00059 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms