Protein–RNA interactions for Protein: P67809

YBX1, Nuclease-sensitive element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1P67809 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
YBX1P67809 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
YBX1P67809 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
YBX1P67809 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
YBX1P67809 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
YBX1P67809 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
YBX1P67809 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
YBX1P67809 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
YBX1P67809 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
YBX1P67809 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YBX1P67809 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YBX1P67809 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YBX1P67809 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YBX1P67809 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
YBX1P67809 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
YBX1P67809 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
YBX1P67809 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YBX1P67809 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
YBX1P67809 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YBX1P67809 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YBX1P67809 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
YBX1P67809 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
YBX1P67809 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
YBX1P67809 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
YBX1P67809 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
YBX1P67809 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
YBX1P67809 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
YBX1P67809 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
YBX1P67809 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
YBX1P67809 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YBX1P67809 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
YBX1P67809 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
YBX1P67809 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YBX1P67809 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YBX1P67809 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
YBX1P67809 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YBX1P67809 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YBX1P67809 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
YBX1P67809 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YBX1P67809 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
YBX1P67809 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YBX1P67809 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YBX1P67809 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YBX1P67809 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YBX1P67809 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YBX1P67809 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
YBX1P67809 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YBX1P67809 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YBX1P67809 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YBX1P67809 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YBX1P67809 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YBX1P67809 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YBX1P67809 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YBX1P67809 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YBX1P67809 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YBX1P67809 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YBX1P67809 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YBX1P67809 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YBX1P67809 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YBX1P67809 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YBX1P67809 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YBX1P67809 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YBX1P67809 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YBX1P67809 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YBX1P67809 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YBX1P67809 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YBX1P67809 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YBX1P67809 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YBX1P67809 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YBX1P67809 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YBX1P67809 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YBX1P67809 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YBX1P67809 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YBX1P67809 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YBX1P67809 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YBX1P67809 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YBX1P67809 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YBX1P67809 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YBX1P67809 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
YBX1P67809 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YBX1P67809 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
YBX1P67809 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YBX1P67809 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YBX1P67809 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YBX1P67809 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YBX1P67809 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
YBX1P67809 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YBX1P67809 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YBX1P67809 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YBX1P67809 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YBX1P67809 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YBX1P67809 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YBX1P67809 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YBX1P67809 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YBX1P67809 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YBX1P67809 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YBX1P67809 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YBX1P67809 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YBX1P67809 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
YBX1P67809 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.8 ms