Protein–RNA interactions for Protein: P62277

RPS13, 40S ribosomal protein S13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS13P62277 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS13P62277 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS13P62277 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS13P62277 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS13P62277 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS13P62277 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS13P62277 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS13P62277 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS13P62277 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS13P62277 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPS13P62277 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RPS13P62277 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPS13P62277 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPS13P62277 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPS13P62277 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS13P62277 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS13P62277 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS13P62277 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS13P62277 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS13P62277 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS13P62277 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS13P62277 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS13P62277 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS13P62277 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS13P62277 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS13P62277 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS13P62277 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS13P62277 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS13P62277 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS13P62277 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS13P62277 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS13P62277 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS13P62277 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS13P62277 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS13P62277 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS13P62277 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS13P62277 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS13P62277 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS13P62277 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS13P62277 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS13P62277 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS13P62277 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS13P62277 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS13P62277 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS13P62277 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS13P62277 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS13P62277 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS13P62277 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS13P62277 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS13P62277 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS13P62277 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS13P62277 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS13P62277 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS13P62277 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS13P62277 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS13P62277 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS13P62277 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS13P62277 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS13P62277 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS13P62277 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS13P62277 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS13P62277 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPS13P62277 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPS13P62277 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPS13P62277 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS13P62277 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS13P62277 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS13P62277 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS13P62277 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS13P62277 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS13P62277 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS13P62277 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS13P62277 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS13P62277 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS13P62277 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS13P62277 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS13P62277 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS13P62277 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS13P62277 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS13P62277 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS13P62277 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS13P62277 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS13P62277 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS13P62277 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS13P62277 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS13P62277 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS13P62277 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS13P62277 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS13P62277 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS13P62277 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS13P62277 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS13P62277 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS13P62277 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS13P62277 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS13P62277 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS13P62277 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS13P62277 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS13P62277 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RPS13P62277 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS13P62277 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms