Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
UBE2HP62256 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE2HP62256 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE2HP62256 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE2HP62256 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE2HP62256 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE2HP62256 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE2HP62256 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE2HP62256 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE2HP62256 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE2HP62256 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBE2HP62256 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE2HP62256 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE2HP62256 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE2HP62256 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE2HP62256 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE2HP62256 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE2HP62256 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE2HP62256 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE2HP62256 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE2HP62256 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE2HP62256 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE2HP62256 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE2HP62256 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE2HP62256 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE2HP62256 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE2HP62256 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE2HP62256 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE2HP62256 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE2HP62256 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE2HP62256 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE2HP62256 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE2HP62256 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE2HP62256 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE2HP62256 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE2HP62256 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE2HP62256 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE2HP62256 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE2HP62256 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE2HP62256 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE2HP62256 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms