Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVS71-1P61550 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms