Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RTP1P59025 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RTP1P59025 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RTP1P59025 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RTP1P59025 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RTP1P59025 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RTP1P59025 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RTP1P59025 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RTP1P59025 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RTP1P59025 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RTP1P59025 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RTP1P59025 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RTP1P59025 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RTP1P59025 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RTP1P59025 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RTP1P59025 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RTP1P59025 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RTP1P59025 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RTP1P59025 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RTP1P59025 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RTP1P59025 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RTP1P59025 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RTP1P59025 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RTP1P59025 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RTP1P59025 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RTP1P59025 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RTP1P59025 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RTP1P59025 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RTP1P59025 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RTP1P59025 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RTP1P59025 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RTP1P59025 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RTP1P59025 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTP1P59025 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTP1P59025 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTP1P59025 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTP1P59025 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTP1P59025 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RTP1P59025 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RTP1P59025 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RTP1P59025 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RTP1P59025 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RTP1P59025 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RTP1P59025 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RTP1P59025 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTP1P59025 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RTP1P59025 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RTP1P59025 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RTP1P59025 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RTP1P59025 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RTP1P59025 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTP1P59025 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTP1P59025 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTP1P59025 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTP1P59025 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTP1P59025 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTP1P59025 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTP1P59025 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTP1P59025 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTP1P59025 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RTP1P59025 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RTP1P59025 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RTP1P59025 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RTP1P59025 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RTP1P59025 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RTP1P59025 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RTP1P59025 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTP1P59025 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTP1P59025 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RTP1P59025 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTP1P59025 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTP1P59025 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTP1P59025 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTP1P59025 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTP1P59025 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTP1P59025 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTP1P59025 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RTP1P59025 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTP1P59025 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTP1P59025 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTP1P59025 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTP1P59025 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RTP1P59025 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTP1P59025 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTP1P59025 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTP1P59025 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTP1P59025 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTP1P59025 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTP1P59025 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTP1P59025 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTP1P59025 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTP1P59025 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RTP1P59025 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTP1P59025 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTP1P59025 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTP1P59025 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTP1P59025 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTP1P59025 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTP1P59025 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RTP1P59025 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms