Protein–RNA interactions for Protein: P55285

CDH6, Cadherin-6, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH6P55285 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH6P55285 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH6P55285 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH6P55285 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH6P55285 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH6P55285 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH6P55285 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH6P55285 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH6P55285 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH6P55285 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH6P55285 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH6P55285 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH6P55285 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH6P55285 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH6P55285 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH6P55285 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH6P55285 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH6P55285 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH6P55285 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH6P55285 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH6P55285 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH6P55285 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH6P55285 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH6P55285 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH6P55285 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH6P55285 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH6P55285 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH6P55285 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH6P55285 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH6P55285 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH6P55285 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH6P55285 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH6P55285 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH6P55285 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH6P55285 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH6P55285 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH6P55285 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH6P55285 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH6P55285 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH6P55285 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH6P55285 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH6P55285 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH6P55285 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH6P55285 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH6P55285 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH6P55285 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH6P55285 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH6P55285 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH6P55285 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH6P55285 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH6P55285 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH6P55285 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH6P55285 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH6P55285 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH6P55285 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH6P55285 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH6P55285 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH6P55285 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH6P55285 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH6P55285 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH6P55285 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH6P55285 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH6P55285 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH6P55285 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH6P55285 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH6P55285 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH6P55285 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH6P55285 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH6P55285 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH6P55285 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH6P55285 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH6P55285 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH6P55285 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH6P55285 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH6P55285 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH6P55285 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH6P55285 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH6P55285 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH6P55285 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH6P55285 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH6P55285 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH6P55285 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDH6P55285 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDH6P55285 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH6P55285 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH6P55285 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH6P55285 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH6P55285 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH6P55285 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH6P55285 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH6P55285 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH6P55285 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH6P55285 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH6P55285 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH6P55285 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH6P55285 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH6P55285 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH6P55285 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH6P55285 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH6P55285 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms