Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP6P55212 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP6P55212 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP6P55212 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP6P55212 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP6P55212 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP6P55212 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP6P55212 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP6P55212 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP6P55212 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP6P55212 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP6P55212 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP6P55212 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP6P55212 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP6P55212 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP6P55212 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP6P55212 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP6P55212 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP6P55212 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP6P55212 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP6P55212 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP6P55212 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP6P55212 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP6P55212 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP6P55212 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP6P55212 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP6P55212 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP6P55212 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP6P55212 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP6P55212 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP6P55212 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP6P55212 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP6P55212 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP6P55212 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP6P55212 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP6P55212 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP6P55212 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP6P55212 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP6P55212 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP6P55212 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP6P55212 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP6P55212 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP6P55212 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP6P55212 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP6P55212 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP6P55212 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP6P55212 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP6P55212 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP6P55212 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP6P55212 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP6P55212 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP6P55212 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP6P55212 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP6P55212 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP6P55212 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP6P55212 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP6P55212 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP6P55212 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP6P55212 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP6P55212 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP6P55212 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP6P55212 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP6P55212 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP6P55212 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP6P55212 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP6P55212 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP6P55212 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP6P55212 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP6P55212 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP6P55212 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP6P55212 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP6P55212 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP6P55212 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP6P55212 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP6P55212 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP6P55212 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP6P55212 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP6P55212 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP6P55212 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CASP6P55212 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP6P55212 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP6P55212 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP6P55212 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP6P55212 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP6P55212 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP6P55212 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP6P55212 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CASP6P55212 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CASP6P55212 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP6P55212 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP6P55212 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP6P55212 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP6P55212 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP6P55212 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP6P55212 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP6P55212 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP6P55212 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP6P55212 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP6P55212 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP6P55212 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.3 ms