Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHB1P54762 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EPHB1P54762 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHB1P54762 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms