Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUCLG1P53597 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUCLG1P53597 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUCLG1P53597 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUCLG1P53597 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUCLG1P53597 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUCLG1P53597 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUCLG1P53597 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUCLG1P53597 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUCLG1P53597 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUCLG1P53597 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUCLG1P53597 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms