Protein–RNA interactions for Protein: P51677

CCR3, C-C chemokine receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR3P51677 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCR3P51677 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCR3P51677 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCR3P51677 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCR3P51677 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCR3P51677 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCR3P51677 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCR3P51677 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCR3P51677 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCR3P51677 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCR3P51677 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCR3P51677 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCR3P51677 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCR3P51677 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCR3P51677 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCR3P51677 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCR3P51677 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCR3P51677 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCR3P51677 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCR3P51677 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCR3P51677 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCR3P51677 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCR3P51677 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCR3P51677 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCR3P51677 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCR3P51677 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCR3P51677 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCR3P51677 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCR3P51677 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCR3P51677 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCR3P51677 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCR3P51677 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCR3P51677 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCR3P51677 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCR3P51677 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCR3P51677 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCR3P51677 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCR3P51677 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCR3P51677 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCR3P51677 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCR3P51677 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCR3P51677 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCR3P51677 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCR3P51677 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCR3P51677 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCR3P51677 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCR3P51677 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCR3P51677 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCR3P51677 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCR3P51677 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCR3P51677 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCR3P51677 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCR3P51677 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCR3P51677 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCR3P51677 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCR3P51677 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCR3P51677 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCR3P51677 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCR3P51677 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCR3P51677 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCR3P51677 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCR3P51677 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCR3P51677 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCR3P51677 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCR3P51677 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCR3P51677 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCR3P51677 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCR3P51677 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCR3P51677 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCR3P51677 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCR3P51677 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCR3P51677 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCR3P51677 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCR3P51677 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCR3P51677 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCR3P51677 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCR3P51677 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCR3P51677 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCR3P51677 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCR3P51677 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCR3P51677 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCR3P51677 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCR3P51677 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCR3P51677 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCR3P51677 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCR3P51677 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCR3P51677 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCR3P51677 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCR3P51677 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCR3P51677 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCR3P51677 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCR3P51677 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCR3P51677 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCR3P51677 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCR3P51677 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCR3P51677 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCR3P51677 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCR3P51677 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCR3P51677 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCR3P51677 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms