Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TM4SF4P48230 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TM4SF4P48230 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TM4SF4P48230 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TM4SF4P48230 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TM4SF4P48230 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TM4SF4P48230 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TM4SF4P48230 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TM4SF4P48230 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TM4SF4P48230 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TM4SF4P48230 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TM4SF4P48230 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TM4SF4P48230 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TM4SF4P48230 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TM4SF4P48230 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TM4SF4P48230 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TM4SF4P48230 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TM4SF4P48230 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TM4SF4P48230 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TM4SF4P48230 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TM4SF4P48230 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TM4SF4P48230 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TM4SF4P48230 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TM4SF4P48230 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TM4SF4P48230 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TM4SF4P48230 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TM4SF4P48230 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TM4SF4P48230 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TM4SF4P48230 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TM4SF4P48230 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TM4SF4P48230 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TM4SF4P48230 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TM4SF4P48230 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TM4SF4P48230 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TM4SF4P48230 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TM4SF4P48230 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TM4SF4P48230 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TM4SF4P48230 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TM4SF4P48230 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TM4SF4P48230 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TM4SF4P48230 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
TM4SF4P48230 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TM4SF4P48230 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TM4SF4P48230 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TM4SF4P48230 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TM4SF4P48230 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TM4SF4P48230 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TM4SF4P48230 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TM4SF4P48230 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TM4SF4P48230 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TM4SF4P48230 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TM4SF4P48230 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TM4SF4P48230 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TM4SF4P48230 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TM4SF4P48230 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TM4SF4P48230 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TM4SF4P48230 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TM4SF4P48230 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TM4SF4P48230 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TM4SF4P48230 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TM4SF4P48230 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms