Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
ITGAEP38570 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ITGAEP38570 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
ITGAEP38570 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ITGAEP38570 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
ITGAEP38570 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ITGAEP38570 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
ITGAEP38570 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
ITGAEP38570 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ITGAEP38570 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ITGAEP38570 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ITGAEP38570 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
ITGAEP38570 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ITGAEP38570 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ITGAEP38570 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ITGAEP38570 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
ITGAEP38570 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ITGAEP38570 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ITGAEP38570 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ITGAEP38570 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ITGAEP38570 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ITGAEP38570 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ITGAEP38570 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ITGAEP38570 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ITGAEP38570 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ITGAEP38570 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ITGAEP38570 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ITGAEP38570 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
ITGAEP38570 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
ITGAEP38570 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
ITGAEP38570 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
ITGAEP38570 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
ITGAEP38570 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
ITGAEP38570 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
ITGAEP38570 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
ITGAEP38570 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
ITGAEP38570 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
ITGAEP38570 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ITGAEP38570 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ITGAEP38570 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ITGAEP38570 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ITGAEP38570 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
ITGAEP38570 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ITGAEP38570 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ITGAEP38570 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ITGAEP38570 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ITGAEP38570 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ITGAEP38570 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ITGAEP38570 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ITGAEP38570 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ITGAEP38570 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ITGAEP38570 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ITGAEP38570 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
ITGAEP38570 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ITGAEP38570 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ITGAEP38570 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ITGAEP38570 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ITGAEP38570 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ITGAEP38570 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ITGAEP38570 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ITGAEP38570 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ITGAEP38570 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ITGAEP38570 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ITGAEP38570 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ITGAEP38570 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ITGAEP38570 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ITGAEP38570 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ITGAEP38570 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
ITGAEP38570 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ITGAEP38570 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ITGAEP38570 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ITGAEP38570 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ITGAEP38570 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ITGAEP38570 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
ITGAEP38570 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ITGAEP38570 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ITGAEP38570 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ITGAEP38570 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ITGAEP38570 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ITGAEP38570 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ITGAEP38570 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ITGAEP38570 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ITGAEP38570 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ITGAEP38570 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ITGAEP38570 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ITGAEP38570 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ITGAEP38570 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ITGAEP38570 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ITGAEP38570 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
ITGAEP38570 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ITGAEP38570 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ITGAEP38570 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ITGAEP38570 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ITGAEP38570 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ITGAEP38570 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ITGAEP38570 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ITGAEP38570 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ITGAEP38570 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ITGAEP38570 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ITGAEP38570 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms