Protein–RNA interactions for Protein: P35219

CA8, Carbonic anhydrase-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA8P35219 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CA8P35219 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CA8P35219 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CA8P35219 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CA8P35219 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CA8P35219 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CA8P35219 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CA8P35219 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CA8P35219 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CA8P35219 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CA8P35219 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CA8P35219 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CA8P35219 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CA8P35219 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CA8P35219 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CA8P35219 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CA8P35219 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CA8P35219 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CA8P35219 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CA8P35219 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CA8P35219 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CA8P35219 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CA8P35219 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CA8P35219 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CA8P35219 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CA8P35219 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CA8P35219 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CA8P35219 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CA8P35219 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CA8P35219 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CA8P35219 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CA8P35219 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CA8P35219 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CA8P35219 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CA8P35219 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CA8P35219 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CA8P35219 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CA8P35219 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CA8P35219 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CA8P35219 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CA8P35219 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CA8P35219 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CA8P35219 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CA8P35219 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CA8P35219 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CA8P35219 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CA8P35219 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CA8P35219 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CA8P35219 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CA8P35219 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CA8P35219 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CA8P35219 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CA8P35219 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CA8P35219 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CA8P35219 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CA8P35219 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CA8P35219 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CA8P35219 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CA8P35219 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CA8P35219 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CA8P35219 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CA8P35219 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CA8P35219 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CA8P35219 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CA8P35219 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CA8P35219 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CA8P35219 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CA8P35219 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CA8P35219 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CA8P35219 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CA8P35219 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CA8P35219 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CA8P35219 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CA8P35219 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CA8P35219 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CA8P35219 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CA8P35219 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CA8P35219 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CA8P35219 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CA8P35219 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CA8P35219 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CA8P35219 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CA8P35219 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CA8P35219 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CA8P35219 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CA8P35219 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CA8P35219 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CA8P35219 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CA8P35219 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CA8P35219 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CA8P35219 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CA8P35219 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CA8P35219 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CA8P35219 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CA8P35219 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CA8P35219 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CA8P35219 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CA8P35219 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CA8P35219 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CA8P35219 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms