Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXC12P31275 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXC12P31275 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms