Protein–RNA interactions for Protein: P29074

PTPN4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4P29074 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN4P29074 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN4P29074 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN4P29074 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN4P29074 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN4P29074 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN4P29074 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN4P29074 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN4P29074 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN4P29074 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN4P29074 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN4P29074 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN4P29074 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN4P29074 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN4P29074 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN4P29074 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN4P29074 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN4P29074 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN4P29074 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN4P29074 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN4P29074 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN4P29074 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN4P29074 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN4P29074 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN4P29074 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN4P29074 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN4P29074 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN4P29074 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN4P29074 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN4P29074 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN4P29074 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN4P29074 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN4P29074 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN4P29074 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN4P29074 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN4P29074 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN4P29074 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN4P29074 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN4P29074 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN4P29074 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN4P29074 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN4P29074 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN4P29074 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN4P29074 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN4P29074 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN4P29074 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN4P29074 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN4P29074 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPN4P29074 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN4P29074 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN4P29074 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN4P29074 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN4P29074 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPN4P29074 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN4P29074 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN4P29074 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN4P29074 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN4P29074 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN4P29074 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN4P29074 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN4P29074 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPN4P29074 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN4P29074 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.2 ms