Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SKIP12755 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SKIP12755 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKIP12755 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKIP12755 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKIP12755 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKIP12755 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKIP12755 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKIP12755 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKIP12755 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKIP12755 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SKIP12755 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKIP12755 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKIP12755 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKIP12755 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKIP12755 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKIP12755 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKIP12755 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKIP12755 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKIP12755 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SKIP12755 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SKIP12755 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SKIP12755 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SKIP12755 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SKIP12755 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SKIP12755 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SKIP12755 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKIP12755 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKIP12755 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKIP12755 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKIP12755 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SKIP12755 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SKIP12755 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKIP12755 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKIP12755 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKIP12755 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKIP12755 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKIP12755 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SKIP12755 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SKIP12755 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SKIP12755 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SKIP12755 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SKIP12755 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SKIP12755 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SKIP12755 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SKIP12755 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SKIP12755 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SKIP12755 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SKIP12755 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SKIP12755 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SKIP12755 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SKIP12755 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SKIP12755 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SKIP12755 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SKIP12755 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SKIP12755 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SKIP12755 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SKIP12755 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
SKIP12755 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SKIP12755 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SKIP12755 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SKIP12755 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SKIP12755 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SKIP12755 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SKIP12755 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SKIP12755 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKIP12755 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKIP12755 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKIP12755 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKIP12755 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKIP12755 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SKIP12755 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SKIP12755 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SKIP12755 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SKIP12755 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SKIP12755 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SKIP12755 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SKIP12755 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SKIP12755 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SKIP12755 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SKIP12755 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SKIP12755 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKIP12755 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKIP12755 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKIP12755 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKIP12755 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SKIP12755 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKIP12755 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKIP12755 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKIP12755 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKIP12755 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKIP12755 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SKIP12755 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SKIP12755 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SKIP12755 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SKIP12755 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SKIP12755 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SKIP12755 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SKIP12755 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SKIP12755 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms