Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLUP10909 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLUP10909 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLUP10909 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLUP10909 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLUP10909 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLUP10909 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLUP10909 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLUP10909 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLUP10909 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLUP10909 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLUP10909 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLUP10909 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLUP10909 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLUP10909 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLUP10909 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLUP10909 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLUP10909 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLUP10909 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLUP10909 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLUP10909 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLUP10909 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLUP10909 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLUP10909 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLUP10909 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLUP10909 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLUP10909 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLUP10909 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLUP10909 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLUP10909 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLUP10909 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLUP10909 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLUP10909 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLUP10909 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLUP10909 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLUP10909 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLUP10909 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLUP10909 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLUP10909 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLUP10909 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLUP10909 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLUP10909 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLUP10909 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLUP10909 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLUP10909 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLUP10909 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLUP10909 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLUP10909 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLUP10909 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLUP10909 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLUP10909 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLUP10909 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLUP10909 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLUP10909 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLUP10909 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLUP10909 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLUP10909 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLUP10909 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLUP10909 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLUP10909 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLUP10909 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLUP10909 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLUP10909 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLUP10909 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLUP10909 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLUP10909 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLUP10909 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLUP10909 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLUP10909 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLUP10909 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLUP10909 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLUP10909 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLUP10909 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLUP10909 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLUP10909 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLUP10909 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLUP10909 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLUP10909 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLUP10909 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CLUP10909 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLUP10909 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLUP10909 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLUP10909 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLUP10909 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLUP10909 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLUP10909 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLUP10909 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLUP10909 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CLUP10909 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLUP10909 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLUP10909 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLUP10909 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLUP10909 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLUP10909 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLUP10909 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLUP10909 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLUP10909 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLUP10909 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLUP10909 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLUP10909 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms