Protein–RNA interactions for Protein: P0DME0

SETSIP, Protein SETSIP, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETSIPP0DME0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SETSIPP0DME0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SETSIPP0DME0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SETSIPP0DME0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SETSIPP0DME0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SETSIPP0DME0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SETSIPP0DME0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SETSIPP0DME0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETSIPP0DME0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETSIPP0DME0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETSIPP0DME0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETSIPP0DME0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETSIPP0DME0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETSIPP0DME0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETSIPP0DME0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETSIPP0DME0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETSIPP0DME0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETSIPP0DME0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETSIPP0DME0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETSIPP0DME0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETSIPP0DME0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms