Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SFTA3P0C7M3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFTA3P0C7M3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFTA3P0C7M3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFTA3P0C7M3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFTA3P0C7M3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFTA3P0C7M3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFTA3P0C7M3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFTA3P0C7M3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFTA3P0C7M3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFTA3P0C7M3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFTA3P0C7M3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFTA3P0C7M3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFTA3P0C7M3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFTA3P0C7M3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFTA3P0C7M3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFTA3P0C7M3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFTA3P0C7M3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFTA3P0C7M3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFTA3P0C7M3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFTA3P0C7M3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFTA3P0C7M3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFTA3P0C7M3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFTA3P0C7M3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFTA3P0C7M3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFTA3P0C7M3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFTA3P0C7M3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFTA3P0C7M3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SFTA3P0C7M3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFTA3P0C7M3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SFTA3P0C7M3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFTA3P0C7M3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFTA3P0C7M3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFTA3P0C7M3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFTA3P0C7M3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFTA3P0C7M3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFTA3P0C7M3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFTA3P0C7M3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms