Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NGFRP08138 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NGFRP08138 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NGFRP08138 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NGFRP08138 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NGFRP08138 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NGFRP08138 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NGFRP08138 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NGFRP08138 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NGFRP08138 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NGFRP08138 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NGFRP08138 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NGFRP08138 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NGFRP08138 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NGFRP08138 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NGFRP08138 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NGFRP08138 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NGFRP08138 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NGFRP08138 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NGFRP08138 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NGFRP08138 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NGFRP08138 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NGFRP08138 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NGFRP08138 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NGFRP08138 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NGFRP08138 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NGFRP08138 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NGFRP08138 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NGFRP08138 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NGFRP08138 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NGFRP08138 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NGFRP08138 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NGFRP08138 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NGFRP08138 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NGFRP08138 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NGFRP08138 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NGFRP08138 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NGFRP08138 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NGFRP08138 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NGFRP08138 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NGFRP08138 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NGFRP08138 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NGFRP08138 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NGFRP08138 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NGFRP08138 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NGFRP08138 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NGFRP08138 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NGFRP08138 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NGFRP08138 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NGFRP08138 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NGFRP08138 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NGFRP08138 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NGFRP08138 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NGFRP08138 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NGFRP08138 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NGFRP08138 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NGFRP08138 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NGFRP08138 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NGFRP08138 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NGFRP08138 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NGFRP08138 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NGFRP08138 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NGFRP08138 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NGFRP08138 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NGFRP08138 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NGFRP08138 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NGFRP08138 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NGFRP08138 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NGFRP08138 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NGFRP08138 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NGFRP08138 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NGFRP08138 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NGFRP08138 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NGFRP08138 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NGFRP08138 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NGFRP08138 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NGFRP08138 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NGFRP08138 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NGFRP08138 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NGFRP08138 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NGFRP08138 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NGFRP08138 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NGFRP08138 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NGFRP08138 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NGFRP08138 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NGFRP08138 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NGFRP08138 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NGFRP08138 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NGFRP08138 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NGFRP08138 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NGFRP08138 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NGFRP08138 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NGFRP08138 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NGFRP08138 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NGFRP08138 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NGFRP08138 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NGFRP08138 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NGFRP08138 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NGFRP08138 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NGFRP08138 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms