Protein–RNA interactions for Protein: P08134

RHOC, Rho-related GTP-binding protein RhoC, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOCP08134 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOCP08134 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOCP08134 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOCP08134 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOCP08134 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOCP08134 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOCP08134 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOCP08134 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOCP08134 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOCP08134 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOCP08134 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOCP08134 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOCP08134 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOCP08134 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOCP08134 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOCP08134 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOCP08134 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOCP08134 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOCP08134 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOCP08134 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOCP08134 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOCP08134 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOCP08134 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOCP08134 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOCP08134 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOCP08134 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOCP08134 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOCP08134 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOCP08134 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOCP08134 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOCP08134 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOCP08134 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOCP08134 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOCP08134 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOCP08134 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOCP08134 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOCP08134 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOCP08134 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOCP08134 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOCP08134 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOCP08134 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOCP08134 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOCP08134 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOCP08134 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOCP08134 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOCP08134 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOCP08134 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOCP08134 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOCP08134 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RHOCP08134 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOCP08134 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOCP08134 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOCP08134 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOCP08134 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOCP08134 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOCP08134 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOCP08134 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOCP08134 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOCP08134 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOCP08134 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOCP08134 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOCP08134 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOCP08134 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOCP08134 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOCP08134 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOCP08134 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOCP08134 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOCP08134 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOCP08134 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOCP08134 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOCP08134 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOCP08134 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOCP08134 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOCP08134 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOCP08134 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOCP08134 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOCP08134 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOCP08134 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOCP08134 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOCP08134 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOCP08134 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOCP08134 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOCP08134 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOCP08134 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOCP08134 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOCP08134 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOCP08134 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOCP08134 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOCP08134 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOCP08134 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOCP08134 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOCP08134 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOCP08134 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RHOCP08134 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RHOCP08134 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RHOCP08134 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RHOCP08134 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHOCP08134 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHOCP08134 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHOCP08134 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.8 ms