Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TPM2P07951 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TPM2P07951 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TPM2P07951 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TPM2P07951 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TPM2P07951 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TPM2P07951 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TPM2P07951 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TPM2P07951 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TPM2P07951 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TPM2P07951 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TPM2P07951 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TPM2P07951 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TPM2P07951 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TPM2P07951 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TPM2P07951 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TPM2P07951 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TPM2P07951 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TPM2P07951 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TPM2P07951 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TPM2P07951 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TPM2P07951 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TPM2P07951 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TPM2P07951 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TPM2P07951 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TPM2P07951 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TPM2P07951 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TPM2P07951 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TPM2P07951 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TPM2P07951 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TPM2P07951 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TPM2P07951 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TPM2P07951 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TPM2P07951 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TPM2P07951 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TPM2P07951 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TPM2P07951 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TPM2P07951 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TPM2P07951 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TPM2P07951 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TPM2P07951 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TPM2P07951 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TPM2P07951 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TPM2P07951 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TPM2P07951 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TPM2P07951 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TPM2P07951 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TPM2P07951 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TPM2P07951 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TPM2P07951 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TPM2P07951 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TPM2P07951 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TPM2P07951 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TPM2P07951 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TPM2P07951 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TPM2P07951 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TPM2P07951 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TPM2P07951 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TPM2P07951 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TPM2P07951 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TPM2P07951 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TPM2P07951 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TPM2P07951 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TPM2P07951 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TPM2P07951 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TPM2P07951 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TPM2P07951 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TPM2P07951 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TPM2P07951 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TPM2P07951 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TPM2P07951 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TPM2P07951 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TPM2P07951 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TPM2P07951 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TPM2P07951 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TPM2P07951 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TPM2P07951 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TPM2P07951 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TPM2P07951 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TPM2P07951 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TPM2P07951 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TPM2P07951 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TPM2P07951 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TPM2P07951 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TPM2P07951 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TPM2P07951 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TPM2P07951 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TPM2P07951 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TPM2P07951 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TPM2P07951 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TPM2P07951 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TPM2P07951 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TPM2P07951 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TPM2P07951 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TPM2P07951 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TPM2P07951 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TPM2P07951 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TPM2P07951 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TPM2P07951 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TPM2P07951 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms