Protein–RNA interactions for Protein: P04632

CAPNS1, Calpain small subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1P04632 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1P04632 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1P04632 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1P04632 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1P04632 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1P04632 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1P04632 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1P04632 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1P04632 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1P04632 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1P04632 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1P04632 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1P04632 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1P04632 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1P04632 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1P04632 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1P04632 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1P04632 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1P04632 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1P04632 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1P04632 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPNS1P04632 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1P04632 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms