Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSO75390 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSO75390 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSO75390 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSO75390 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSO75390 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSO75390 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSO75390 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSO75390 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSO75390 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSO75390 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSO75390 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSO75390 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSO75390 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSO75390 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSO75390 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSO75390 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSO75390 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSO75390 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSO75390 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CSO75390 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CSO75390 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSO75390 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSO75390 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSO75390 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSO75390 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSO75390 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSO75390 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSO75390 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSO75390 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSO75390 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSO75390 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSO75390 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSO75390 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CSO75390 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSO75390 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSO75390 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSO75390 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSO75390 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSO75390 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSO75390 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSO75390 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSO75390 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSO75390 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSO75390 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSO75390 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSO75390 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSO75390 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSO75390 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSO75390 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSO75390 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSO75390 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSO75390 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSO75390 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSO75390 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSO75390 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CSO75390 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CSO75390 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSO75390 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSO75390 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSO75390 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSO75390 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSO75390 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSO75390 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSO75390 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSO75390 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSO75390 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSO75390 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSO75390 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSO75390 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CSO75390 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSO75390 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSO75390 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSO75390 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSO75390 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSO75390 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSO75390 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSO75390 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CSO75390 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSO75390 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSO75390 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSO75390 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSO75390 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSO75390 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSO75390 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSO75390 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CSO75390 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSO75390 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSO75390 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSO75390 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSO75390 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSO75390 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSO75390 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSO75390 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSO75390 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSO75390 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSO75390 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSO75390 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CSO75390 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CSO75390 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms